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中山大学附属第五医院高通量测序(产前诊断、病源微生物)采购项目005号变更公告
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一、采购项目编号:【2026】采购耗材005

二、采购项目名称: 高通量测序(产前诊断、病源微生物)

三、项目资金来源:医院自筹

变更前:采购项目需求

序号

项目名称

配置/功能需求

1

胎儿染色体非整倍体无创产前基因检测

1.检测项目配置

1)须能检测21、18、13染色体的非整倍体异常。

2)需满足2016国家卫生计生委办公厅发布的《孕妇外周血胎儿游离DNA产前筛查与诊断技术规范》中实验流程的质量控制及数据分析和技术参数标准以及检测范围,21 三体综合征检出率应不低于99%,18 三体综合征检出率应不低于97%,13 三体综合征检出率应不低于90%;复合假阳性率应不高于0.5%。

3)在基础NIPT基础上,尽可能扩展配置对染色体微缺失/微重复综合征的检测功能,如10号染色体异常、猫叫综合征、天使综合征等。

2.样本采集与处理配置

1)具有血浆游离DNA专用采血管,确保血液样本稳定,避免溶血或凝血影响检测。

2)具有专业的线上和微信扫码信息收集系统,能稳定对接医院的产前系统。

3.质量控制配置:配置阴性质控品、阳性质控品和无模板对照,每批次检测时与临床样本同步检测,确保结果准确性。设置测序深度、碱基质量值、有效数据量、GC含量等质量控制参数,对数据进行实时监测和评估。

2

地中海贫血基因检测(α+β)(高通量测序)

1.地贫基因检测靶标范围须同时包含α-地中海贫血(缺失型:--SEA, -α3.7, -α4.2 ——THAI等;非缺失型:Hb CS, Hb QS,Hb WS关键点突变);β-地中海贫血(涵盖中国人群常见的至少20种点突变,如CD41-42, IVS-II-654, -28, CD17等及常见中国型缺失等);及更多罕见HBA和HBB基因突变位点检测。并能区分α-地贫的三联体(ααα)异常。

3

遗传性耳聋基因检测(4个基因20位点)(高通量测序)

1.可对含新生儿在内的个体进行耳聋基因的检测。

2.覆盖GJB2、GJB3、SLC26A4及MT-RNR1这4个耳聋基因的常见位点数≥20个位点。

4

病原微生物宏基因组测序(DNA)

1、测序读长:单端读长不低于50 bp(建议双端测序)。

2、测序数据量:单个临床样本有效测序数据量不低于 2 M(raw reads),对于低微生物量样本可说明数据量保障策略。

3、测序质量:Q30 碱基比例不低于90%。

4、测序平台与原理:采用经过充分验证的“边合成边测序(SBS)”或“联合探针锚定聚合测序技术”,平台需获得国家药品监督管理局(NMPA)医疗器械注册证。

5、每批次实验包含阴性对照、阳性对照及内参(如人工合成或已知低浓度病原体标准品),并在报告中明确呈现质控结果。可检测样本类型包括但不限于以下种类:呼吸道标本、骨关节感染标本、尿液标本、分泌物标本、全血标本、血浆标本、脑脊液标本、胸水标本、腹水标本、组织标本、囊肿标本等,且提供相应的样本接收手册等技术指导文件,对样本采集和质量要求提供技术指导。

6、具备临床级病原微生物专业数据库,要求如下:包含细菌、真菌(含酵母、丝状真菌)、病毒(DNA/RNA)、寄生虫、支原体/衣原体、立克次体等病原体种类,总数建议不低于15,000 种。

7、具备独立的耐药基因数据库与毒力因子数据库,并能实现耐药基因与病原体的关联分析、毒力因子注释及临床意义解读。

5

病原微生物宏基因组测序(RNA)

1、测序读长:单端读长不低于50 bp(建议双端测序)。

2、测序数据量:单个临床样本有效测序数据量不低于 2 M(raw reads),对于低微生物量样本可说明数据量保障策略。

3、测序质量:Q30 碱基比例不低于90%。

4、测序平台与原理:采用经过充分验证的“边合成边测序(SBS)”或“联合探针锚定聚合测序技术”,平台需获得国家药品监督管理局(NMPA)医疗器械注册证。

5、每批次实验包含阴性对照、阳性对照及内参(如人工合成或已知低浓度病原体标准品),并在报告中明确呈现质控结果。可检测样本类型包括但不限于以下种类:呼吸道标本、骨关节感染标本、尿液标本、分泌物标本、全血标本、血浆标本、脑脊液标本、胸水标本、腹水标本、组织标本、囊肿标本等,且提供相应的样本接收手册等技术指导文件,对样本采集和质量要求提供技术指导。

6、具备临床级病原微生物专业数据库,要求如下:包含细菌、真菌(含酵母、丝状真菌)、病毒(DNA/RNA)、寄生虫、支原体/衣原体、立克次体等病原体种类,总数建议不低于15,000 种。

7、具备独立的耐药基因数据库与毒力因子数据库,并能实现耐药基因与病原体的关联分析、毒力因子注释及临床意义解读。

6

病原微生物宏基因组测序(DNA和RNA)

1、测序读长:单端读长不低于50 bp(建议双端测序)。

2、测序数据量:单个临床样本有效测序数据量不低于 2 M(raw reads),对于低微生物量样本可说明数据量保障策略。

3、测序质量:Q30 碱基比例不低于90%。

4、测序平台与原理:采用经过充分验证的“边合成边测序(SBS)”或“联合探针锚定聚合测序技术”,平台需获得国家药品监督管理局(NMPA)医疗器械注册证。

5、每批次实验包含阴性对照、阳性对照及内参(如人工合成或已知低浓度病原体标准品),并在报告中明确呈现质控结果。可检测样本类型包括但不限于以下种类:呼吸道标本、骨关节感染标本、尿液标本、分泌物标本、全血标本、血浆标本、脑脊液标本、胸水标本、腹水标本、组织标本、囊肿标本等,且提供相应的样本接收手册等技术指导文件,对样本采集和质量要求提供技术指导。

6、具备临床级病原微生物专业数据库,要求如下:包含细菌、真菌(含酵母、丝状真菌)、病毒(DNA/RNA)、寄生虫、支原体/衣原体、立克次体等病原体种类,总数建议不低于15,000 种。

7、具备独立的耐药基因数据库与毒力因子数据库,并能实现耐药基因与病原体的关联分析、毒力因子注释及临床意义解读。

变更后:

序号

项目名称

配置/功能需求

1

胎儿染色体非整倍体无创产前基因检测

1.检测项目配置

1)须能检测21、18、13染色体的非整倍体异常。

2)需满足2016国家卫生计生委办公厅发布的《孕妇外周血胎儿游离DNA产前筛查与诊断技术规范》中实验流程的质量控制及数据分析和技术参数标准以及检测范围,21 三体综合征检出率应不低于99%,18 三体综合征检出率应不低于97%,13 三体综合征检出率应不低于90%;复合假阳性率应不高于0.5%。

3)在基础NIPT基础上,尽可能扩展配置对染色体微缺失/微重复综合征的检测功能,如10号染色体异常、猫叫综合征、天使综合征等。

2.样本采集与处理配置

1)具有血浆游离DNA专用采血管,确保血液样本稳定,避免溶血或凝血影响检测。

2)具有专业的线上和微信扫码信息收集系统,能稳定对接医院的产前系统。

3.质量控制配置:配置阴性质控品、阳性质控品和无模板对照,每批次检测时与临床样本同步检测,确保结果准确性。设置测序深度、碱基质量值、有效数据量、GC含量等质量控制参数,对数据进行实时监测和评估。

2

地中海贫血基因检测(α+β)(高通量测序)

1.地贫基因检测靶标范围须同时包含α-地中海贫血(缺失型:--SEA, -α3.7, -α4.2 ——THAI等;非缺失型:Hb CS, Hb QS,Hb WS关键点突变);β-地中海贫血(涵盖中国人群常见的至少20种点突变,如CD41-42, IVS-II-654, -28, CD17等及常见中国型缺失等);及更多罕见HBA和HBB基因突变位点检测。并能区分α-地贫的三联体(ααα)异常。

3

遗传性耳聋基因检测(4个基因20位点)(高通量测序)

1.可对含新生儿在内的个体进行耳聋基因的检测。

2.覆盖GJB2、GJB3、SLC26A4及MT-RNR1这4个耳聋基因的常见位点数≥20个位点。

4

病原微生物宏基因组测序(DNA)

1、测序读长:单端读长不低于50 bp(建议双端测序)。

2、测序数据量:单个临床样本有效测序数据量不低于 2 M(raw reads),对于低微生物量样本可说明数据量保障策略。

3、测序质量:Q30 碱基比例不低于90%。

4、测序平台与原理:采用经过充分验证的“边合成边测序(SBS)”或“联合探针锚定聚合测序技术”,平台需获得国家药品监督管理局(NMPA)医疗器械注册证。

5、每批次实验包含阴性对照、阳性对照及内参(如人工合成或已知低浓度病原体标准品),并在报告中明确呈现质控结果。可检测样本类型包括但不限于以下种类:呼吸道标本、骨关节感染标本、尿液标本、分泌物标本、全血标本、血浆标本、脑脊液标本、胸水标本、腹水标本、组织标本、囊肿标本等,且提供相应的样本接收手册等技术指导文件,对样本采集和质量要求提供技术指导。

6、具备临床级病原微生物专业数据库,要求如下:包含细菌、真菌(含酵母、丝状真菌)、病毒(DNA/RNA)、寄生虫、支原体/衣原体、立克次体等病原体种类,总数建议不低于15,000 种。

7、具备独立的耐药基因数据库与毒力因子数据库,并能实现耐药基因与病原体的关联分析、毒力因子注释及临床意义解读。

5

病原微生物宏基因组测序(RNA)

1、测序读长:单端读长不低于50 bp(建议双端测序)。

2、测序数据量:单个临床样本有效测序数据量不低于 2 M(raw reads),对于低微生物量样本可说明数据量保障策略。

3、测序质量:Q30 碱基比例不低于90%。

4、测序平台与原理:采用经过充分验证的“边合成边测序(SBS)”或“联合探针锚定聚合测序技术”,平台需获得国家药品监督管理局(NMPA)医疗器械注册证。

5、每批次实验包含阴性对照、阳性对照及内参(如人工合成或已知低浓度病原体标准品),并在报告中明确呈现质控结果。可检测样本类型包括但不限于以下种类:呼吸道标本、骨关节感染标本、尿液标本、分泌物标本、全血标本、血浆标本、脑脊液标本、胸水标本、腹水标本、组织标本、囊肿标本等,且提供相应的样本接收手册等技术指导文件,对样本采集和质量要求提供技术指导。

6、具备临床级病原微生物专业数据库,要求如下:包含细菌、真菌(含酵母、丝状真菌)、病毒(DNA/RNA)、寄生虫、支原体/衣原体、立克次体等病原体种类,总数建议不低于15,000 种。

7、具备独立的耐药基因数据库与毒力因子数据库,并能实现耐药基因与病原体的关联分析、毒力因子注释及临床意义解读。

6

病原微生物宏基因组测序(DNA和RNA)

1、测序读长:单端读长不低于50 bp(建议双端测序)。

2、测序数据量:单个临床样本有效测序数据量不低于 2 M(raw reads),对于低微生物量样本可说明数据量保障策略。

3、测序质量:Q30 碱基比例不低于90%。

4、测序平台与原理:采用经过充分验证的“边合成边测序(SBS)”或“联合探针锚定聚合测序技术”,平台需获得国家药品监督管理局(NMPA)医疗器械注册证。

5、每批次实验包含阴性对照、阳性对照及内参(如人工合成或已知低浓度病原体标准品),并在报告中明确呈现质控结果。可检测样本类型包括但不限于以下种类:呼吸道标本、骨关节感染标本、尿液标本、分泌物标本、全血标本、血浆标本、脑脊液标本、胸水标本、腹水标本、组织标本、囊肿标本等,且提供相应的样本接收手册等技术指导文件,对样本采集和质量要求提供技术指导。

6、具备临床级病原微生物专业数据库,要求如下:包含细菌、真菌(含酵母、丝状真菌)、病毒(DNA/RNA)、寄生虫、支原体/衣原体、立克次体等病原体种类,总数建议不低于15,000 种。

7、具备独立的耐药基因数据库与毒力因子数据库,并能实现耐药基因与病原体的关联分析、毒力因子注释及临床意义解读。

7

病原微生物靶向高通量测序

1. 实验方法为探针捕获法,支持呼吸道样本检测。靶标范围内包含常见呼吸道病原体及耐药基因、结核耐药基因。

2. 测序读长:单端读长不低于50 bp

联系方式: 0756-2528874(秋老师)

联系地址:中山大学附属第五医院分子影像中心旁4A号后勤楼107办公室(珠海市香洲区梅华东路52号)

中山大学附属第五医院

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